miRWalk數據庫是一個集miRNA查詢、miRNA靶基因及pathway查詢于一體的在線、免費數據庫。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和魚6物種。

l  miRNA查詢

       首先選擇要查詢物種，然后輸入miRNA名稱（注意名稱中使用“-”而非下劃線），可以獲取miRNA序列及靶基因列表。miRWalk中靶基因列表可以點擊“Export”輸出為csv格式文件。

如果按基因查詢，可以輸入基因名、基因ID等。查詢結果將顯示基因基本信息及靶向該基因的miRNA列表。

l  Target Mining

該模塊可以對多個 miRNA /基因/特定通路進行搜索。

       根據miRNA列表搜索，需要選擇物種、ID類型。結果頁面為靶基因列表，“Graph”為網絡圖結果，GSEA可以在KEGG、GO層面對靶基因進行富集分析。（根據基因搜索步驟、結果頁內容與miRNA相同）

      根據Pathway搜索，選擇物種、數據庫之后，下拉列表選擇特定的通路即可查詢。結果頁面為靶向該通路中所有基因的miRNA。