蛋白質是細胞的結構、功能和進化單元。在它們的表面，蛋白質被塑造成許多凹陷和突起，為配體結合和催化提供獨特的微環(huán)境。這些空腔的動力學、大小和化學性質對于蛋白質功能的機制理解至關重要。
CaviDB，一個關于已知蛋白質結構中空腔及其特征的新數(shù)據(jù)庫。它將常用空腔檢測軟件的結果與序列、結構和功能分析得出的蛋白質特征相結合。CaviDB中的每一種蛋白質都與其相應的構象體相連，這也有助于研究空腔中的構象變化。
           https://www.cavidb.org/

           CaviDB的使用很簡單，只需提供蛋白的PDB ID、UniProt ID、UniProt條目名稱或Alphabold ID，數(shù)據(jù)庫將自動加載與搜索相關的所有鏈及其一般數(shù)據(jù)，包括它們的長度、預測的腔數(shù)和相關的交叉引用標識符。以P42898為例：

           點擊眼睛跳轉至該條目的詳情頁，包括：

           1. 蛋白及對應基因的ID、蛋白結構展示：

           2. Druggable腔（Druggability score>0.5）用圖標標記，并且可以通過位于序列可視化之前的按鈕進行選擇或取消選擇。

           每個條目的主要結構可以以兩種不同的表示形式顯示：字母湯和類似周期表的可視化。

           3. 蛋白詳細描述