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一些好用的tRFs數據庫

欄目:最新研究動態 發布時間:2017-11-30
在幾個惡性腫瘤中發現了幾個trna衍生的片段,參與細胞增殖、凋亡和侵襲性轉移......

在幾個惡性腫瘤中發現了幾個trna衍生的片段,參與細胞增殖、凋亡和侵襲性轉移。這些失調的片段能夠結合阿爾戈里的蛋白質和皮維蛋白來調節基因表達。一些新發現的trna基因片段被認為是治療癌癥的新生物標記和治療靶點。本文綜述了不同亞型的trna-衍生片段的生物起源和生物學功能,并討論了它們在癌癥進展中的分子機制。

tRFs( tRNA-derived fragments)是來源于tRNA前體或成熟的tRNA的非編碼小片段。最近的一些研究表明tRFs在多種腫瘤中異常表達,有些tRFs參與了某些惡性腫瘤的細胞增殖、凋亡和侵襲轉移,這些差異表達的tRFs主要通過結合AGO蛋白及PIWI蛋白調控基因的表達。此外一些研究表明tRFs還可以做腫瘤的biomarker及治療靶點。隨著越來越多的研究者的關注,tRF將成為下一個非編碼RNA的研究熱點。接下來小編為大家介紹幾個tRF常用數據庫,方便大家進行相關研究。

1、tRFdb   http://genome.bioch.virginia.edu/trfdb/search.php

tRFdb數據庫主要收集了人,小鼠,線蟲等7個物種的tRFs序列,總共2513條序列,其中人的序列552條, 收集的序列不多. 該數據庫主要收集了tRF-1, tRF-3, tRF-5序列,并提供ID,序列兩種查詢方式.

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